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Apéndice B
Preparación de los ensayos
Ensayos AQ y CpG
Cuando cree un ensayo AQ o CpG, la secuencia que se
debe analizar debe contener un número suficiente de bases
para generar como mínimo cinco picos de referencia no
variables. Para las InDels se deben incluir unos cuantos
picos de referencia delante de la posición variable.
Si coloca el cebador de secuenciación en la posición
adyacente a la posición que se debe analizar, incluya parte
de la secuencia que sigue a la posición variable en el cuadro
de texto "Sequence to Analyze" (Secuencia que se debe
analizar). Asegúrese de que la última base del cuadro de
texto no forme parte de la posición variable.
El software genera automáticamente dosificaciónes vacías
que sirven de controles de calidad integrados para el
ensayo. No excluya nunca las dosificaciones vacías, ya que
actúan como indicadores excelentes de las incorporaciones
inespecíficas de nucleótidos. Si genera un orden de
dosificación manualmente, incluya un número adecuado de
dosificaciones vacías. Si es posible, inicie el orden de
dosificación con una dosificación vacía e incluya como
mínimo el mismo número de dosificaciones vacías que el
número de posiciones variables.
Preste atención a los consejos y a las advertencias indicados
por el icono rojo
aparece este icono.
Controles de tratamiento de bisulfito en los ensayos
CpG
Cuando cree un ensayo CpG, se recomienda incluir
controles del tratamiento de bisulfito. Las citosinas a las que
no sigue una guanina, indicadas como T naranjas en el
PyroMark ADSW, se deben convertir totalmente a timina
durante el tratamiento de bisulfito y se pueden utilizar por
consiguiente como controles para la reacción. Cuando cree
B-6
y realice las modificaciones pertinentes si
Manual de usuario del PyroMark Q24 MDx 01/2016
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