Gestión De Errores; Transferencia De Datos; Flujo De Trabajo De Análisis En Tiempo Real - Illumina HiSeq 4000 Guía Del Sistema

Guía del sistema HiSeq 4000
RTA2 proporciona criterios de medición en tiempo real de experimentos de calidad guardados como
archivos InterOp. Los archivos InterOp son archivos binarios que contienen datos relacionados con placas,
ciclos y lecturas y se requieren para la visualización de datos en el visor del análisis de secuenciación. Para
ver los criterios de medición generados por RTA2, utilice SAV v1.10.2 o una versión posterior.
Para obtener información detallada sobre cada archivo de resultados, consulte
secuenciación en la página
Gestión de errores
RTA2 crea archivos de registro y los guarda en la carpeta RTALogs. Los errores se registran en un archivo de
errores con formato *.tsv.
Los archivos de error y de registro siguientes se transfieren a la ubicación de destino de los resultados finales
tras completar el procesamiento:
*GlobalLog*.tsv contiene un resumen de los eventos importantes del experimento.
u
*LaneNLog*.tsv enumera los eventos de procesamiento de cada carril.
u
*Error*.tsv enumera los errores que se han producido durante un experimento.
u
*WarningLog*.tsv enumera las advertencias que se han producido durante un experimento.
u

Transferencia de datos

A lo largo del experimento, RTA2 solicita la transferencia de datos al servicio de copia de experimentos, el
software que gestiona la transferencia a la ubicación de la carpeta de resultados especificada. Si se utiliza
BaseSpace Sequence Hub, BaseSpace Broker gestiona la transferencia de datos a BaseSpace Sequence
Hub. Si la conexión de red se interrumpe, RTA2 continúa con el procesamiento y registra los datos de forma
local. La transferencia de datos se reanuda una vez restablecida la conexión.
NOTA
Asegúrese de que la conexión de red satisfaga los requisitos mínimos para el envío de datos del
experimento a BaseSpace Sequence Hub. Para obtener más información, consulte la guía de preparación
del centro.
Cuando finaliza el procesamiento, RTA2 crea un archivo de marcador denominado RTAComplete.txt. La
transferencia de datos termina cuando se genera este archivo. El indicador del sensor situado en la parte
inferior de la pantalla muestra el estado de la transferencia. Para obtener más información, consulte
Indicadores de actividad y del sensor en la página
Flujo de trabajo de análisis en tiempo real
Generación de plantillas
Registro y extracción de
intensidad
Corrección de la matriz de
color
Corrección empírica de
hebras retrasadas
Llamada de bases
N.º de documento 15066496 v05 ESP N.º de material 20015630
Para uso exclusivo en investigación. Prohibido su uso en procedimientos de diagnóstico.
45.
5.
Sirve para asignar las ubicaciones de grupos.
Registra la ubicación de cada grupo en la celda de flujo estampada y determina un valor de
intensidad para cada grupo.
Corrige la comunicación cruzada entre canales.
Corrige los efectos de hebra retrasada y hebra adelantada.
Determina una llamada de bases para cada grupo.
Archivos de resultados de
40