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Guía del sistema HiSeq 2000
Generación de plantillas
La generación de plantillas localiza y determina la posición de cada grupo en una placa mediante
coordenadas X e Y. La plantilla se utiliza como referencia en el paso siguiente de registro y extracción
de intensidad.
Dada la matriz aleatoria de los grupos de la celda de flujo, la generación de plantillas precisa de los datos de
las imágenes de los primeros cinco ciclos del experimento. Tras el último ciclo de la plantilla para la
adquisición de imágenes de una placa, se genera la plantilla.
Las posiciones en los grupos se escriben en un archivo de ubicación de grupos (*.locs) o en un archivo de
ubicación de grupos comprimido (*.clocs) para cada placa. Para obtener más información, consulte
de resultados de secuenciación en la página
Registro y extracción de intensidad
El registro y la extracción de intensidad se inician tras generar la plantilla de las posiciones de grupos.
El registro alinea las imágenes generadas en cada ciclo posterior a la generación de plantillas con
u
la plantilla.
La extracción de intensidad determina un valor de intensidad para cada grupo de la plantilla para una
u
imagen determinada.
Si se produce un error en el registro de cualquier imagen en un ciclo, no se generará ninguna llamada de
bases para esa placa en ese ciclo. Utilice el SAV para examinar las imágenes en miniatura e identificar las
imágenes que no se han podido registrar.
Corrección de la matriz de color
Tras el registro y la extracción de intensidad, RTA corrige las interferencias entre canales. Las interferencias
se producen cuando un grupo muestra intensidad en el canal C y, al mismo tiempo, cierta intensidad en el
canal A, por ejemplo. Mediante el uso de una matriz de color de 4 x 4, RTA genera intensidades corregidas
de matriz con interferencias reducidas o inexistentes, y equilibra diferencias de intensidad global entre
canales de color.
Corrección empírica de hebras retrasadas
Durante la reacción de secuenciación, cada cadena de ADN de un grupo se amplía en una base por cada
ciclo. Las hebras retrasadas y hebras adelantadas se producen cuando una cadena queda fuera de su lugar
con respecto al ciclo de incorporación.
N.º de documento 15011190 v02 ESP
Para uso exclusivo en investigación. Prohibido su uso en procedimientos de diagnóstico.
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