Introducción
El PyroMark Q24 Control Oligo permite verificar la correcta instalación del
sistema PyroMark Q24 MDx. Además, se puede utilizar en la resolución de
problemas para determinar si un resultado inesperado está relacionado con el
instrumento, con la estación de vacío PyroMark Q24 MDx o con el ensayo.
Principio y procedimiento
El PyroMark Q24 Control Oligo contiene un oligonucleótido biotinilado que
permite al usuario verificar que el PyroMark Q24 MDx y la estación de vacío
PyroMark Q24 MDx funcionan correctamente.
En condiciones definidas, el oligonucleótido firma una estructura de horquilla
interna. Esta estructura permite el autocebado del oligonucleótido para
extensión por la acción de la ADN-polimerasa y elimina la necesidad de un
cebador de secuenciación en la reacción de pirosecuenciación. La región
secuenciada incluye bases individuales de todos los nucleótidos,
homopolímeros de dos y tres bases, y una base inestable/degenerada. El
software analiza automáticamente esta posición variable y presenta los
resultados como % de C y % de T. En la figura 1 se muestra la estructura del
oligonucleótido.
A
B
Figura 1. Estructura del PyroMark Q24 Control Oligo.
oligonucleótido.
B
Estructura autocebada del oligonucleótido, en la que se indica la secuencia
analizada.
Descripción de los protocolos
Se recomienda realizar dos series analíticas para verificar la correcta
instalación del sistema PyroMark Q24 MDx.
Funcionamiento del PyroMark Q24 MDx
Para verificar el correcto funcionamiento del PyroMark Q24 MDx, siga el
procedimiento "Protocolo: Verificación del funcionamiento del PyroMark Q24
MDx", página 10. El PyroMark Q24 Control Oligo se agrega directamente a la
Manual de uso del PyroMark Q24 Control Oligo 06/2009
Región secuenciada
A
Biotina
Biotina
Estructura abierta del
7