Illumina NextSeq 1000 Guia Del Usuario página 116

Guía del sistema de secuenciación NextSeq 1000 y 2000
Requisitos del proceso de amplicones de ADN de DRAGEN
Estos son los campos y descripciones de [DragenAmplicon_Settings] disponibles.
Campo
SoftwareVersion
ReferenceGenomeDir
DnaBedFile
DnaGermlineOrSomatic
KeepFastq
MapAlignOutFormat
Estos son los campos y descripciones de [DragenAmplicon_Data] disponibles.
N.º de documento 1000000109376 v05 ESP
Para uso exclusivo en investigación. Prohibido su uso en procedimientos de diagnóstico.
Necesario Descripción
Sí La versión del software DRAGEN instalada
actualmente en el sistema. Utilice los tres
números enteros incluidos en el nombre de la
versión. Por ejemplo, 3.5.7.
La versión del software debe coincidir con la
versión especificada en la sección BCLConvert_
Settings.
Sí El nombre del genoma de referencia. Por
ejemplo, hg38_alt_aware. Los genomas de
referencia se encuentran en
/usr/local/illumina/genomes. Para utilizar
un genoma de referencia personalizado,
consulte la Ayuda en línea de la aplicación
Reference Builder para Illumina Instruments
v1.0.0.
Sí El archivo *.bed que contiene las regiones a las
que se dirigirá. El archivo *.bed puede
introducirse en formato de archivo *.txt o *.gz.
Sí Para realizar un análisis germinal de amplicones
de ADN, escriba germline (germinal). Para
realizar un análisis somático de amplicones de
ADN, escriba somatic (somático).
No Para guardar archivos de resultados FASTQ,
escriba true (verdadero). Para eliminar archivos
de resultados FASTQ, escriba false (falso).
No El formato del archivo de resultados. Los valores
permitidos son bam o cram. Si no se especifica
ningún valor, no hay ningún valor
predeterminado.
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