Guía del sistema de secuenciación NextSeq 1000 y 2000
Las intensidades de cada grupo se extraen de la imagen verde y de la azul y se comparan una con otra,
lo que produce cuatro poblaciones diferenciadas. Cada población se corresponde con una base. El
proceso de llamada de bases determina a qué población pertenece cada grupo.
Tabla 6
Llamada de bases en secuenciación de dos canales
Canal
Base
verde
A
1
(presente)
C
0
(ausente)
G
0
(ausente)
T
1
(presente)
Figura 6 Visualización de intensidades de grupos
El color de cada grupo se correlaciona con los diagramas porcentaje de bases en Sequence
Analysis Viewer (SAV) y los datos del experimento de BaseSpace Sequence Hub por ciclo, no
se correlacionan con los canales verde y azul.
Grupos que superan el filtro
Durante el experimento, RTA3 filtra incidencias para eliminar las lecturas que no satisfagan el umbral
de calidad de los datos. Los grupos que se solapan o de baja calidad se eliminan.
N.º de documento 1000000109376 v05 ESP
Para uso exclusivo en investigación. Prohibido su uso en procedimientos de diagnóstico.
Canal azul
Resultado
1
Los grupos que presentan intensidad en los canales verde y
(presente)
azul.
1
Los grupos que presentan intensidad solo en el canal azul.
(presente)
0
Grupos que no presentan intensidad en una ubicación de
(ausente)
grupos conocida.
0
Los grupos que presentan intensidad solo en el canal verde.
(ausente)
67