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Illumina NextSeq 2000 Guia Del Usuario (131 páginas)
Sistema de secuenciación
Marca:
Illumina
| Categoría:
Equipos de Laboratorio
| Tamaño: 1.98 MB
Tabla de contenido
Historial de Revisiones
3
Tabla de Contenido
8
Descripción General del Sistema
10
Otros Recursos
11
Hardware del Instrumento
12
Conexiones de Alimentación y Auxiliares
13
Compartimento de Consumibles
13
Software Integrado
14
Información del Sistema
15
Notificaciones y Alertas
15
Minimizar el Software de Control
15
Process Management (Gestión del Proceso)
15
Estado del Experimento
16
Estado del Análisis Secundario
16
Estado de la Carpeta de Resultados
16
Solución de Problemas de Estado
16
Diagrama del Protocolo de Secuenciación
17
Cómo Funciona la Secuenciación
17
Secuenciación
18
Análisis Secundario
18
Configuración del Sistema
20
Requisitos de la Cuenta de Usuario
20
Requisitos de las Contraseñas
20
Añadir Nuevo Usuario
21
Restablecer la Contraseña
21
Restablecer la Contraseña de Usuario
22
Restablecer la Contraseña de Administrador
22
Restablecer la Contraseña de Superadministrador
22
Configuración de Basespace Sequence Hub y la Asistencia de Proactive
22
Especificación de la Ubicación de la Carpeta de Resultados Predeterminada
24
Especificación de una Unidad Externa como la Carpeta de Resultados
24
Especificación de una Carpeta de Resultados Predeterminada en una Unidad de Red
25
Especificación de la Unidad de Red Permanente como la Carpeta de Resultados Predeterminada
27
Importación de Genomas de Referencia Personalizados
27
Import Noise Baseline Files (Importar Archivos de Referencia de Ruido)
28
Generar un Archivo de Referencia de Ruido Personalizado
28
Importación de Archivos de Referencia Mediante la Interfaz de Usuario
28
Importación de Archivos de Referencia a Través del Terminal
29
Configuración del Modo de Experimento
29
Modo Local O Standalone (Independiente)
30
Consideraciones de la Hoja de Muestras para el Modo Local O Standalone (Independiente)
30
Personalización del Instrumento
30
Configurar las Preferencias de Desnaturalización y Dilución
31
Establecer la Preferencia de Purgado Automático de Reactivos
31
Configurar Actualizaciones de Software
32
Configuración de un Servidor Proxy
32
Consumibles y Equipos
34
Consumibles de Secuenciación
34
Celda de Flujo
35
Número de Ciclos Admitido
36
Descripción de Símbolos
36
Consumibles Auxiliares
37
Equipo Auxiliar
40
Protocolo
41
Consideraciones de Secuenciación
41
Concentraciones y Volumen de Carga
41
Planificación de un Experimento de Secuenciación en Basespace Sequence Hub
43
Configuración de Experimentos
43
Configuración de un Análisis Secundario
45
Descongelación del Cartucho en la Bolsa y la Celda de Flujo
51
Descongelación del Cartucho en un Baño de Agua Controlado
52
Descongelación del Cartucho en un Refrigerador
53
Descongelación del Cartucho a Temperatura Ambiente
53
Dilución de Bibliotecas
54
Adición de un Control Phix (Opcional)
55
Carga de Consumibles en el Cartucho
56
Preparación del Cartucho
56
Carga de Bibliotecas
57
Inicio de un Experimento de Secuenciación
58
Inicio de un Experimento Cloud (Nube) O Hybrid (Híbrido)
59
Inicio de un Experimento Local
60
Inicio de un Experimento Standalone (Independiente)
62
Carga de Los Consumibles en el Instrumento
63
Comprobaciones Previas al Experimento
64
Supervisión del Progreso del Experimento
65
Descarga de Consumibles
65
Reciclaje de Los Componentes del Cartucho
66
Limpie la Bandeja del Cartucho
71
Resultados de Secuenciación
72
Descripción General de Análisis en Tiempo Real
72
Resultados de RTA3
72
Gestión de Errores
73
Nomenclatura de Placas
74
Flujo de Trabajo de Análisis en Tiempo Real
74
Extracción de Intensidad
75
Corrección de Hebra Retrasada
75
Llamada de Bases
75
Grupos que Superan el Filtro
76
Puntuaciones de Calidad
77
Puntuación de Calidad y Elaboración de Informes
77
Archivos de Resultados de Secuenciación
78
L[Carril]_[Superficie].Cbcl, por Ejemplo L001_1.Cbcl
78
Archivos de Resultados del Análisis Secundario de DRAGEN
79
Informe de Estadísticas de Demultiplexado
85
Informes de Criterios de Medición del Adaptador
86
Informe de Principales Códigos de Barras Desconocidos
87
Estructura de Carpetas de Resultados de Análisis Secundario de DRAGEN
90
Mantenimiento
94
Liberación de Espacio en el Disco Duro
94
Actualizaciones de Software
95
Instalación de una Actualización Manual del Software
95
Instalar una Actualización Manual del Software
96
Actualizaciones de Flujos de Trabajo y Licencias de DRAGEN
97
Sustitución del Filtro de Aire
98
Solución de Problemas
101
Resolución de Mensajes de Error
101
Devolución de Los Consumibles a Almacenamiento
102
Cancelación de un Experimento
102
Volver a Poner en Cola un Experimento
103
Ciclo de Apagado y Encendido del Instrumento
103
Realizar una Comprobación del Sistema
104
Ejecución de una Comprobación del Sistema
105
Restablecimiento a la Configuración de Fábrica
105
Captura de una Imagen de Instalación
105
Restauración de la Imagen Capturada
106
Recursos y Referencias
107
Configuración de la Hoja de Muestras V2
107
Requisitos de [Header] (Encabezado)
107
Requisitos de [Reads] (Lecturas)
108
Requisitos de [Sequencing_Settings] (Configuración de Secuenciación)
109
Requisitos de BCL Convert (Conversión de BCL)
109
Configuración de las Hojas de Muestras de DRAGEN
111
Requisitos del Proceso DRAGEN Germline
111
Requisitos del Proceso DRAGEN Enrichment
114
Secuenciación Mediante Ciclo de Oscuridad
123
Edición del Archivo de la Fórmula
123
Adición de la Fórmula al Experimento
124
Índice Alfabético
125
Asistencia Técnica
129
N.º de Documento 1000000109376 V05 ESP
131
Publicidad
Illumina NextSeq 2000 Guia (81 páginas)
Marca:
Illumina
| Categoría:
Secuenciadores
| Tamaño: 1.39 MB
Tabla de contenido
Historial de Revisiones
3
Tabla de Contenido
5
Descripción General del Sistema
7
Otros Recursos
8
Hardware del Instrumento
9
Conexiones de Alimentación y Auxiliares
9
Compartimento de Consumibles
10
Software Integrado
11
Información del Sistema
11
Notificaciones y Alertas
11
Minimizar el Software de Control
11
Process Management (Gestión del Proceso)
12
Estado del Experimento
12
Estado del Análisis Secundario
12
Diagrama del Protocolo de Secuenciación
13
Cómo Funciona la Secuenciación
13
Generación de Grupos
14
Secuenciación
14
Análisis Secundario
14
Configuración del Sistema
16
Requisitos de la Cuenta de Usuario
16
Requisitos de las Contraseñas
16
Configuración de Basespace Sequence Hub y la Asistencia de Proactive
16
Especificación de la Ubicación de la Carpeta de Resultados Predeterminada
18
Especificación de una Unidad Externa como la Carpeta de Resultados
18
Especificación de una Carpeta de Resultados Predeterminada en una Unidad de Red
18
Especificación de la Unidad de Red Permanente como la Carpeta de Resultados Predeterminada
20
Importación de Genomas de Referencia Personalizados
20
Configuración del Modo de Experimento
21
Modo Local O Standalone (Independiente)
21
Consideraciones de la Hoja de Muestras para el Modo Local O Standalone (Independiente)
22
Personalización del Instrumento
22
Establecer la Preferencia de Purgado Automático de Reactivos
22
Configurar Actualizaciones de Software
22
Consumibles y Equipos
23
Consumibles de Secuenciación
23
Celda de Flujo
23
Número de Ciclos Admitido
25
Descripción de Símbolos
25
Consumibles Auxiliares
26
Consumibles para Secuenciación
26
Consumibles para el Mantenimiento
27
Equipo Auxiliar
27
Protocolo
29
Consideraciones de Secuenciación
29
Concentraciones y Volumen de Carga
29
Número de Ciclos de una Lectura
30
Planificación de un Experimento de Secuenciación en Basespace Sequence Hub
30
Configuración de Experimentos
30
Configuración de un Análisis Secundario
32
Descongelación del Cartucho en la Bolsa
35
Descongelación en un Baño de Agua Controlado
35
Descongelación en un Refrigerador
36
Descongelación a Temperatura Ambiente
36
Preparación de la Celda de Flujo y de las Bibliotecas
37
Preparación de la Celda de Flujo y del Cartucho
37
Dilución de la Biblioteca a 2 Nm
37
Dilución de la Biblioteca a 2 Nm para la Concentración de Carga
38
Adición de un Control Phix (Opcional)
38
Carga de Consumibles en el Cartucho
39
Preparación del Cartucho
39
Carga de la Celda de Flujo
39
Carga de Bibliotecas
40
Inicio de un Experimento de Secuenciación
41
Inicio de un Experimento Cloud (Nube) O Hybrid (Híbrido)
41
Inicio de un Experimento Local
42
Inicio de un Experimento Standalone (Independiente)
43
Carga de Los Consumibles en el Instrumento
44
Comprobaciones Previas al Experimento
44
Supervisión del Progreso del Experimento
45
Descarga de Consumibles
45
Resultados de Secuenciación
47
Descripción General de Análisis en Tiempo Real
47
Entradas de RTA3
47
Resultados de RTA3
47
Gestión de Errores
48
Placas de la Celda de Flujo
48
Nomenclatura de Placas
48
Flujo de Trabajo de Análisis en Tiempo Real
49
Extracción de Intensidad
49
Corrección de Hebra Retrasada
49
Llamada de Bases
50
Grupos que Superan el Filtro
51
Puntuaciones de Calidad
51
Puntuación de Calidad y Elaboración de Informes
52
Archivos de Resultados de Secuenciación
53
Archivos de Resultados del Análisis Secundario de DRAGEN
53
Informe de Estadísticas de Demultiplexado
56
Informes de Criterios de Medición del Adaptador
57
Informe de Recuentos de Saltos de Índices
57
Informe de Principales Códigos de Barras Desconocidos
58
Estructura de Carpetas de Resultados de Análisis Secundario de DRAGEN
58
Mantenimiento
60
Liberación de Espacio en el Disco Duro
60
Actualizaciones de Software
60
Instalación de una Actualización Manual del Software
61
Instalar una Actualización Manual del Software
61
Actualizaciones de Procesos y Licencias de DRAGEN
62
Renovación en Línea de la Licencia de DRAGEN
62
Renovación sin Conexión de la Licencia de DRAGEN
62
Instalación de las Actualizaciones del Proceso
62
Sustitución del Filtro de Aire
63
Solución de Problemas
65
Resolución de Mensajes de Error
65
Devolución de Los Consumibles a Almacenamiento
65
Cancelación de un Experimento
66
Volver a Poner en Cola un Experimento
66
Ciclo de Apagado y Encendido del Instrumento
67
Restablecimiento a la Configuración de Fábrica
68
Captura de una Imagen de Instalación
68
Restauración de la Imagen Capturada
69
Recursos y Referencias
70
Configuración de la Hoja de Muestras V2
70
Requisitos de [Header] (Encabezado)
70
Requisitos de [Reads] (Lecturas)
70
Requisitos de BCL Convert (Conversión de BCL)
71
Configuración de las Hojas de Muestras de DRAGEN
72
Requisitos del Proceso DRAGEN Germline
73
Requisitos del Proceso DRAGEN RNA
74
Requisitos del Proceso DRAGEN Enrichment
75
Índice Alfabético
76
Asistencia Técnica
80
N.º de Documento 1000000109376 V01 ESP
81
Para Uso Exclusivo en Investigación
81
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