Informes De Criterios De Medición Del Adaptador; Informe De Recuentos De Saltos De Índices - Illumina NextSeq 2000 Guia

Guía del sistema de secuenciación NextSeq 2000
Informes de criterios de medición del adaptador
El archivo de criterios de medición del adaptador incluye el número de bases de adaptador y de muestra
asociadas a cada lectura.
Se incluye la siguiente información.
Criterio de medición
Lane
Sample_ID
index
index2
R1_AdapterBases
R1_SampleBases
R2_AdapterBases
R2_SampleBases
# Reads
Informe de recuentos de saltos de índices
El informe de recuentos de saltos de índices contiene el número de lecturas para cada índice esperado
y saltado para experimentos de indexado doble. El informe solo incluye índices dobles únicos por carril
en los que no se detecta ningún conflicto de código de barras en ninguno de los índices. Para generar
mediciones de salto de índices para un carril, cada par de entradas de cada índice debe tener una
distancia de Hamming de al menos 2N +1, donde N representa la tolerancia de incoherencia del código
de barras especificada para el índice.
Se incluye la siguiente información.
Para experimentos no indexados, experimentos de índice individual o carriles que no contienen índices
dobles únicos, el archivo solo contiene el encabezado.
Criterio de medición
Lane
# Reads
N.º de documento 1000000109376 v01 ESP
Para uso exclusivo en investigación.
Prohibido su uso en procedimientos de diagnóstico.
Descripción
El carril de la celda de flujo donde se ha secuenciado la muestra.
El ID de la muestra de la hoja de muestras. Si una lectura no se
corresponde con una muestra, el campo muestra undetermined (sin
determinar).
La secuencia del Índice 1 de la hoja de muestras. El campo está vacío si
el índice no se ha especificado en la hoja de muestras o si el valor del ID
de la muestra es undetermined (sin determinar).
La secuencia de index2 de la hoja de muestras. El campo está vacío si
index2 no se ha especificado en la hoja de muestras o si el valor del ID
de la muestra es undetermined (sin determinar).
El número de bases correspondiente a AdapterRead1 en la hoja de
muestras.
Número de bases recortadas o enmascaradas de la Lectura 1 para el
carril y la muestra correspondientes.
El número de bases correspondiente a AdapterRead2 en la hoja de
muestras.
Número de bases recortadas o enmascaradas de la Lectura 2 para el
carril y la muestra correspondientes.
El número de lecturas de la muestra del carril especificado.
Descripción
El carril de la celda de flujo donde se ha secuenciado la muestra.
El número de lecturas de la muestra del carril especificado.
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