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Guía del sistema de secuenciación NextSeq 2000
Criterio de medición
SampleID
index
index2
Informe de principales códigos de barras desconocidos
El informe de principales códigos de barras desconocidos contiene los 100 principales índices o pares
de índices por carril que no se identificaron en la hoja de muestras según el número de incoherencias
permitidas. Si hay varios valores de índice situados como la entrada más alta de recuento de índices en
el número 100, todos los valores de índice con el mismo recuento se generan como la entrada número
100.
Se incluye la siguiente información:
Criterio de medición
Lane
index
index2
# Reads
Estructura de carpetas de resultados de análisis secundario de DRAGEN
DRAGEN genera de forma predeterminada los archivos de resultados en la carpeta de resultados
seleccionada en la pestaña Settings (Configuración).
*stderr_.txt
*stdout_.txt
dragen_prev_24_hrs.log
SampleSheet.csv
Archivos de entrada de experimentos (p. ej. archivos BED, GTF)
nombre_muestra
enrich_caller, germline_seq o rna_seq
dragen_*.log
nombre_muestra.*.metrics.csv
N.º de documento 1000000109376 v01 ESP
Para uso exclusivo en investigación.
Prohibido su uso en procedimientos de diagnóstico.
Descripción
El ID de la muestra de la hoja de muestras. Si una lectura no se
corresponde con una muestra, el campo muestra undetermined (sin
determinar).
La secuencia del Índice 1 de la hoja de muestras. El campo está vacío si
una lectura es individual o el valor del ID de la muestra es
undetermined (sin determinar).
La secuencia de index2 de la hoja de muestras. El campo está vacío si
una lectura es individual o el valor del ID de la muestra es
undetermined (sin determinar).
Descripción
El carril de la celda de flujo donde se ha secuenciado la muestra.
La secuencia de cada índice desconocido en la Lectura 1 del índice. El
campo está vacío si no se encuentran índices desconocidos.
La secuencia de cada índice desconocido en la Lectura 2 del índice. El
campo está vacío si el experimento es de lectura individual o no se
encuentran índices desconocidos.
El número de lecturas de la muestra del carril especificado.
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