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C Química de síntesis de oligonucleótidos
C.2 Química de protección
Desprotección de fosfatos
El método recomendado para eliminar el grupo ß-cianoetilo del esqueleto del fosfato
es el tratamiento con dietilamina (DEA) al 20 % en acetonitrilo.
La desprotección de fosfatos también se obtiene con hidróxido de amonio concentrado.
Esto, no obstante, puede provocar modificaciones de las bases heterocíclicas.
Protección de hidroxilo de azúcar
(temporal)
El grupo 5'-hidroxilo del nucleótido entrante se protege con un grupo 4,4'-dimetoxitritilo
(DMTr), como muestra la siguiente imagen.
El grupo DMTr lábil al ácido es estable en condiciones de acoplamiento controladas. La
absorbancia o la conductividad se miden cuando el DMTr se escinde, para obtener una
medida de la eficiencia del acoplamiento.
Desprotección de hidroxilo de azúcar
El grupo hidroxilo de azúcar se elimina al principio de cada ciclo de síntesis mediante
tratamiento con ácido dicloroacético (DCA) al 3 % en tolueno.
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ÄKTA oligopilot plus Instrucciones de funcionamiento 28959748 AE
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