Ajustes De Barrido - Agilent SureScan G4900DA Guia Del Usuario

Locked Cuando un protocolo está bloqueado, no puede cambiarse.

Ajustes de barrido

Dye channel Determina si se recopila sólo rojo (por ejemplo, pigmento Cy-5), sólo verde (por ejemplo, pigmento
Cy-3), o ambos tipos de información del canal de pigmentos. La selección no afecta el tiempo del
barrido, pero al seleccionar sólo un canal de pigmento se reduce el tamaño de archivo a la mitad.
Scan region Scan region determina el área de la placa que se procesa. Debe ser lo suficientemente grande para
capturar toda la región de impresión de la microarray. Debe ser lo suficientemente pequeña para evitar
realizar el barrido demasiado cerca del código de barras u otras áreas de los bordes de la placa no
transparentes y que afecten la capacidad del escáner de realizar el enfoque automático debidamente.
Minimizar la región de barrido también reduce el tiempo de barrido y ahorra espacio de almacenamiento.
Agilent proporciona una región de barrido adecuada para todas las placas de alta densidad y G3
de Agilent, y otra adecuada para realizar el barrido completo de placas de 1 x 3 sin etiquetas de
códigos de barras.
En placas que no son de Agilent, es posible que tenga que utilizar una región de barrido
personalizada que se adapte mejor a la región impresa. Consulte
de barrido"
Resolution Establece la resolución de barrido (tamaño en píxeles) en 2, 3, 5 y 10 micras.
En barridos de 10 micras, cada fila de píxeles en la imagen TIFF representa la media de dos líneas de
barrido, una adquirida en cada dirección. En barridos de 5, 3 y 2 micras, puede seleccionar un barrido de
doble paso para realizar esta media o adquirir sólo una línea de barrido única para cada fila de imagen.
Un modo de barrido de alta sensibilidad está también disponible en todas las resoluciones de barrido.
El modo de barrido de alta sensibilidad proporciona una sensibilidad comparable a la del modo de
pasada doble pero reduciendo los tiempos de barrido en un 25%. El modo de alta sensibilidad se
puede seleccionar en el menú desplegable Resolution el Editor de protocolos del escáner.
TIFF Dynamic Establece el rango dinámico en 16 o 20 bits. El escáner G4900DA ha ampliado el intervalo
Range dinámico de PMT y los componentes electrónicos de procesamiento de señales. Al seleccionar la
opción de archivo TIFF de 20 bits, puede acceder a este intervalo ampliado, para posibilitar la
cuantificación de las características de señales altas o bajas en un solo barrido.
El software Scan Control aún posibilita el barrido convencional XDR de 16 bits, como se describe
a continuación.
N OTA
Tabla 11
barridos de uno y dos pasos para cada resolución seleccionada, para un intervalo dinámico de
TIFF de 16 bits o de 20 bits. La región de barrido es 61 x 21,6 mm.
La barra de estado situada en la parte inferior de la ventana principal Scan Control muestra una estimación
del espacio de almacenamiento y el tiempo de ejecución necesario para la cola de placas actual.
Guía del usuario del Sistema SureScan
en la página 39.
Si se selecciona la opción de 20 bits, no se permite la opción XDR, y si ya está
seleccionada una opción XDR, se restablece automáticamente.
muestra el espacio de almacenamiento y el tiempo de barrido correspondiente a
"Creación y cambio de regiones
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