Agilent G2565CA Guia Del Usuario página 51

Sistema de escáner de microarrays
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Dye channel
Scan region
Guía del usuario del Sistema de scanner de microarrays Agilent G2565CA (Scan Control Software 8.5)
Entrada manual
códigos de barra o placas con formatos de códigos de barra no
admitidos, utilizando el teclado o un lector de códigos de barra
externo apropiado.
Si introduce el ID a través del teclado, haga doble clic en la
celda del ID de placa antes de introducir el código de barras o
un identificador de texto único.
Comprobación de códigos de barra admitidos por Agilent y ranuras
vacías
comprobar las ranuras vacías en la columna de ID de placa,
haga clic en Tools (Herramientas) > Carousel Check
(Comprobación de carrusel).
El programa comprueba primero las ranuras vacías del
carrusel y etiqueta como "No chip" (Sin chip) cada celda del
ID de placa que no tenga placa. A continuación, el programa
lee los códigos de barra de todas las placas y los coloca en las
celdas de ID de placa.
Determina si se recopila sólo rojo (por ejemplo, pigmento Cy-5),
(Canal de
sólo verde (por ejemplo, pigmento Cy-3), o ambas informaciones
pigmento)
del canal. La selección no afecta al tiempo del barrido, pero al
seleccionar sólo un canal de pigmento reduce el tamaño de
archivo en la mitad.
La scan region (región de barrido)determina el área de la
(Región de
placa que se procesa. Debe ser lo suficientemente grande para
barrido)
capturar toda la región de impresión de la microarray. Debe ser
lo suficientemente pequeña para evitar procesar demasiado
cerca del código de barras u otras áreas de los bordes de la
placa no transparentes y que afecten a la capacidad del scanner
de realizar el enfoque automático debidamente. Minimizar la
región de barrido también reducirá el tiempo de barrido y el
espacio de almacenamiento.
Agilent proporciona una región de barrido adecuada para todas
las placas de alta densidad y Agilent G3, y otra adecuada para
procesar completamente entre 1 y 3 placas sin etiquetas de
códigos de barra.
Modificación de los ajustes de barrido
Debe introducir los ID de placas que no tengan
Para ver códigos de barra admitidos por Agilent y
3
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