Red PMT Gain (Ganancia
de PMT de rojo)
Green PMT Gain
(Ganancia de PMT de
(Relación XDR)
Guía del usuario del Sistema de scanner de microarrays Agilent G2565CA (Scan Control Software 8.5)
Tabla 1
Resolución
Un paso de 2 micras
Un paso de 3 micras
Un paso de 5 micras
Un paso de 10 micras
Dos pasos de 2 micras
Dos pasos de 3 micras
Dos pasos de 5 micras
Los barridos de dos pasos no requieren más espacio de
almacenamiento que los barridos de un paso, pero tardan el
doble de tiempo en completarse.
Ajusta el nivel de sensibilidad del PTM de canal rojo y de
canal verde. El PMT detecta la fluorescencia emitida por la
y
microarray.
El nivel de salida predeterminado (100%) ajusta la ganancia al
nivel calibrado de fábrica; éste es el ajuste recomendado para
verde)
microarrays Agilent. Puede reducir cada ajuste de canal de
color independientemente hasta un mínimo de 1%.
Si una microarray es tan brillante que se satura el extremo
superior de la señal de salida, el nivel de sensibilidad del PMT
puede reducirse a un intervalo de sensibilidad que permita la
lectura de toda la información.
XDR Ratio
Antes de la disponibilidad del intervalo dinámico de TIFF de
20 bits, se tenía que utilizar eXtended Dynamic Range (función)
en el scanner en el software Feature Extraction para capturar
todos los datos procesados entre características de señales muy
bajas y características de señales muy altas. Ahora puede
Modificación de los ajustes de barrido
Espacio de almacenamiento y tiempo de barrido en barridos de
uno y dos pasos para la región de barrido HD de Agilent de 61 x
21,6 mm
Espacio de
almacenamiento,
Mb, 16 bits
1300
620
200
52
1300
620
200
Espacio de
Tiempo de
almacenamiento,
barrido, min.
Mb, 20 bits
1600
20
760
15
300
8
115
8
1600
40
760
30
300
16
3
53