Qiagen Rotor-Gene Q MDx Manual Del Usuario página 99

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Reaction Efficiency Threshold
La medida "Reaction Efficiency Threshold" (Umbral de eficiencia de la
(Umbral de eficiencia de la
reacción) es un método alternativo de exclusión de ruido del análisis. Este
reacción):
algoritmo de normalización emplea las técnicas de estimación de la eficiencia
de la reacción utilizadas en la cuantificación comparativa (consulte el
apartado 6.6.6). Las muestras que no tengan una eficiencia de reacción como
mínimo de este nivel se excluirán y se mostrará un indicador "NEG (R.Eff)" en
la columna "CT Comment" (Comentario de CT).
Un nivel del 0 % indica que, durante la fase exponencial, no se produjo
ninguna reacción. Un 100 % indica que, durante la fase exponencial, se
produjo una reacción totalmente eficiente. Los porcentajes negativos indican
que, durante la fase exponencial, la señal fluorescente disminuyó.
Las investigaciones actuales no son concluyentes en cuanto a los niveles
precisos de eficiencia necesarios para diferenciar entre las reacciones
genuinas por contaminación y otros efectos. Por este motivo, se recomienda
utilizar esta función con prudencia, partiendo de la base de que cualquier
muestra con una reacción genuina presentará alguna fase exponencial visible
con algún aumento de la fluorescencia. Si este valor se establece por encima
del 0 %, se excluirán algunas muestras con un aumento ineficiente pero
perceptible de la fluorescencia, mientras que si se establece por debajo del
0 %, se mostrarán muestras que vieron reducida su fluorescencia durante la
fase exponencial y sin duda deberían excluirse.
Nota: Si se excluye un valor debido a la activación de alguna de estas técnicas, no se mostrará el
correspondiente en la ventana Quantitation Results (Resultados de cuantificación).
valor de C
T
De forma simultánea, se mostrará un indicador que informa sobre la exclusión en la columna
"CT Comment" (Comentario de CT). Por lo tanto, es importante asegurarse de que la columna
"CT Comment" (Comentario de CT) se muestra en todo momento.
En la imagen siguiente, se puede observar que las muestras 7, 8 y 9 fueron excluidas debido a la
medida "Reaction Efficiency Threshold" (Umbral de eficiencia de la reacción).
Pendiente, amplificación, eficiencia de la reacción
La pendiente (M) de una reacción (se muestra en la ventana Standard Curve [Curva estándar])
puede utilizarse para determinar la amplificación exponencial y la eficiencia de una reacción
mediante los cálculos siguientes:
Amplificación exponencial = 10
Eficiencia de la reacción = [10
Manual del usuario de Rotor-Gene Q MDx CE 02/2022
(–1/M)
] – 1
(–1/M)
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